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实验外包-RT-PCR/荧光定量PCR结果分析
实验外包
-RT-PCR/
荧光定量
PCR
结果分析
real time pcr结果分析
Delta Cq ,Cq mean都是在设置的时候必须做的,哪几个孔是重复的,然后机器就会算。是看你的加样误差。
分析的时候只看一个,就是Ct (Cq) 值。先把内参的Cq值的平均数相减(假设你同一个样本一次做了3个孔,就取3个孔的平均数),算出加样的差别。然后再把目标基因的Cq值相减,算出差别,再除以内参的差别,就得到目的基因的差别倍数。
统计学分析要等到你重复至少3次以上完全独立的试验,再做PCR后算出差异倍数,才能做。不然统计的是你的加样误差和机器的分析误差,没有任何意义。
荧光定量PCR结果分析
如果有标准曲线,按照标准曲线计算。
一般都是相对量。则用delta delta CT方法来计算。举例如下:
对照组基因A的CT值为20, 内参(比如βactin)CT值15。实验组基因A CT值18,内参CT值14。
首先算加样量:delta CT=15-14=1。2的1次方是2。也就是说实验组的加样量是对照组的2倍。
基因A: delta CT=20-18=2。2的2次方是4。也就是说基因A的量在实验组是对照组的4倍。但是由于加样量是2倍,所以4处以2=2,*后的相对量是2倍。
几点注意:
1。必须确定扩增的特异性
2。 只有相同目标的CT值才能相减(扩增效率有可能不同)
3。 2的某次方只是理论值,实际扩增效率低于2。
4。 *好不用Syber Green
实验外包
-RT-PCR/
荧光定量
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结果分析
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