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总RNA提取技术服务|实验技术服务

关键词:总RNA提取技术服务|实验技术服务
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测序实验流程：
（一）细胞总RNA的提取
1、6孔板细胞汇合度为90-100%时，取出无菌室，去其上清，用PBS洗两次后，每孔加TRIZOL试剂 1 ml，摇匀，无菌罩内消化3-5 min。
2、将各孔内消化好的细胞裂解液吸到一DEPC处理过的1.5 ml EP管中，加新开的氯仿0.2 ml，轻摇15 s。
3、室温静置2-3 min后，12000 rpm，15 min，4 ℃，离心。然后取上清无色水相（约0.6 ml）到 EP管（DEPC处理过），加0.5 ml新开的异丙醇，室温下静置10 min。
4、12000 rpm，10 min，4 ℃，离心。观察总RNA在管底的白色沉淀，弃去上清，75%乙醇1.0 ml洗涤（用DEPC水新配制）后，7500 rpm，5 min，4 ℃离心。
5、去上清，点离，用小Tip吸干液体。气干沉淀5-10 min， DEPC处理水20-30 μl加入，中枪打匀，55-60 ℃水浴10 min溶解总RNA，测OD值。
6、电泳。
（二）从总RNA中分离mRNA（Oligotex mRNA Mini Kit,Cat.no.:70022, QIAGEN）
1、取上述提取的总RNA若干（少于0.25 mg）到一个新的无RNase 的EP管中，用无RNase的水定容到250 μl。
2、加入Buffer OBB 250 μl, Oligotex Suspension 15 μl。用Tip打匀或用手弹匀。
3、70℃水浴，3 min（裂解RNA的二级结构）。
4、20-30℃条件下，静置10 min（让Oligotex与mRNA结合）。
5、高速离心2 min，小心吸走上清（该上清要保留），留下约50 μl的上清在原管里。
6、用Buffer OW2 400 μl重悬含Oligotex/mRNA复合物的沉淀，然后将这些加到套有1.5 ml EP管的SPIN柱子上，高速离心1 min。
7、将SPIN柱子移到一个新的EP管上，加Buffer OW2 400 μl到柱子，高速离心1 min，丢掉滤过液。
8、将SPIN柱子移到一个新的EP管上，加20-100 μl热的（70 ℃）Buffer OEB到柱子上，用Tip来回吸打3-4 次，高速离心1 min。
9、为保证*大的 mRNA产量，可再次重复第8步。
10、电泳。
操作步骤
1. 取新鲜或冰冻动物组织块0.1g（0.5cm3），尽量剪碎。置于玻璃匀浆器中，加入1ml的细胞裂解缓冲液匀浆至不见组织块，转入1.5ml 离心管中，加入蛋白酶K （500ug/ml）20μl，混匀。在65℃恒温水浴锅中水浴30min，也可转入37℃水浴12-24h，间歇振荡离心管数次。于台式离心机以12000 rpm离心5min，取上清液入另一离心管中。
2.加2倍体积异丙醇，倒转混匀后，可以看见丝状物，用100μl 吸头挑出，凉干，用200μlTE 重新溶解。（可进行PCR反应等，需要进一步纯化的按下列步骤进行。）
3.加等量的酚，氯仿，异戊醇（25:24:1）、振荡混匀，离心12000 rpm，5min。
4.取上层溶液至另一管，加入等体积的氯仿，异戊醇（24：1），振荡混匀，离心12000 rpm，5min。
5. 取上层溶液至另一管，加入1/2体积的7.5mol/L乙酸氨加入2倍体积的无水乙醇，混匀后室温沉淀2min ，离心12000 rpm ，10min。
6.小心倒掉上清液，将离心管倒置于吸水纸上，将附于管壁的残余液滴除掉。
7.用1ml 70%乙醇洗涤沉淀物1次，离心12000 rpm，5min。
8.小心倒掉上清液，将离心管倒置于吸水纸上，将附于管壁的残余液滴除掉，室温干燥。
9.加200ul TE重新溶解沉淀物，然后置于4℃或-20℃保存备用。
10.吸取适量样品于GeneQuant上检测浓度和纯度。

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