药品冻干机其原理先将湿物料在其冰点温度下冻结，得到稳定的固体骨架，然后在适合的真空度下进行升温，使冰直接升华为水蒸气，再利用真空系统的冷凝器将水蒸气凝结，从而获得干燥产品。
中药冻干过程是低温低压下水的物态变化和移动过程，基本原理就是低温低压下的传热传质。
该冻干技术与其他干燥方法相比有很多优点：可避免药品中热敏性成分分解变质； 可使物料中的易氧化成分不致氧化变质，尤其适合中药中热敏性高，极易氧化且不稳定物料的干燥； 所得制品质地疏松，呈多孔结构，复水性好，能够恢复药液原有的性状； 冻干制品含水量低，有利于产品的长期保存； 易实现无菌操作，整个过程污染机会相对较少，所得产品临床效果好，过敏现象少、副作用小。
