事发后，石门县教育局紧急通知全县对所有现存"学生奶"予以封存。经石门县疾控中心检测，确认引起学生呕吐、**的主要原因是供应的"学生奶"中蜡样芽孢杆菌超标。
常德市质监局分析：少量花生味"学生奶"出现感官异常、菌落总数超标是单独个体现象，主要原因为该公司配送的运输车辆超量、超层、超压堆码，产品包装受到挤压碰撞，产品包装的密封性因严重挤压受到隐性破坏，导致产品与空气接触受到污染（蜡样芽孢杆菌超标），饮用后引起不适症状。
9月25日，湖南阳光乳业股份有限公司公开致歉，承认在"学生奶"配送环节未按标准操作。