转录组测序是指对用多聚胸腺嘧啶进行亲和纯化的成熟mRNA和ncRNA进行高通量测序,从而检测物种的整体转录活动。跟传统的芯片杂交平台相比,转录组测序无需预先设计已知序列的探针,便能提供高通量**的数字化信号,是目前深入研究转录组复杂性的强大工具。 相较于其他的基因测序,转录组测序能够更**更快速地获取某一物种特定器官或组织在某一状态下的几乎所有转录本,轻松反映出此器官或组织的表达信息,根据转录本信息开展个体基因表达调控或者在不同环境下基因表达的差异的研究,是辅助临床医药研究、分子诊断、基础科学研究必不可少的检测手段。
差异基因火山图,可以观察到差异基因总体分布
样本接收: 一、Total RNA。样本量:m≥20 μg;浓度:c≥200ng/μL;纯度:OD260/280≥1.8~2.2,OD260/230≥2.0;完整性:RIN ≥ 7.0,28S:18S ≥1.5 二、(1)新鲜动物组织(干重):1~2g;(2)新鲜植物组织(干重):3~4g;(3)新鲜培养细胞:8×106~9×107个;(4)全血:5ml以上;(5)菌液:50ml新鲜培养菌液
实验方案:
信息分析项目: 一、基本信息分析 1、按标准流程进行base calling、raw data数据整理及数据质量评估。 二、标准信息分析 1、与参考序列比对,计算不同基因的RPKM值; 2、基因的差异表达分析; 3、新转录本的预测; 4、可变剪切分析; 5、变异检测及注释; 6、基因组表达模式分析。 三、根据客户需求进行个性化分析
普朗医疗是一家集研发、生产、销售、服务为一体的医疗企业,公司产品畅销海内外,广受好评!目前,普朗医疗与东南大学共同投资创办了南京普东兴生物科技有限公司,专业从事高通量基因测序仪及配套试剂的研发、生产和销售,并全方位的为客户提供数据分析和信息服务。产品主要应用于科学研究、个性化医疗健康、临床检测、生物生态分析等领域。目前,项目的测序核心技术及配套试剂已经成熟,并将于未来大规模产业化发展。国内免费咨询电话:400-6656-888。