DNA聚合酶要进行DNA聚合反应时一定要有引子 (primer),因为它只能以引子所的3'-OH为起始点进行延伸 (extension) 的工作,而不能就地重新合成新的DNA (de novo synthesis)。 一般实验常以人工合成的寡核苷酸为引子进行DNA聚合反应,这时固然可以根据已知序列设计核酸引子,但也可以采用逢机引子(random primers)。 所谓逢机引子即其序列为逢机序列,不经特别设计,目前应用广者是以自动化机器所合成的、六到八个核苷酸长的寡核苷酸混合物;反应进行中若有任何一条逢机引子结合到模版DNA,即可引导DNA聚合反应的进行。 以random priming方法进行核酸标定,是以逢机引子引导Klenow fragment(large fragment of E. coli DNA polymerase I)进行DNA聚合反应,并在反应过程中添加 [α-32P]dNTP或DIG-11-dUTP等标定物质。 而为了避免random priming也发生于载体部份的DNA,好不要直接以质体DNA为模版进行标定反应,而应预先将目标DNA自载体切除出来。 仪器用具:微量离心机;沸水浴及冰浴 药品试剂: 模版DNA (pBlueGus 的BamHI-HindIII DNA 片段,将由助教) 0.2 M EDTA, pH 8.0 4 M LiCl Random priming kit (Roche): Hexanucleotide mix (random primer) dNTP mixture (1 mM dATP, 1 mM dCTP, 1 mM dGTP, 0.65 mM dTTP, 0.35 mM DIG-11-dUTP, pH 7.5) Klenow enzyme (2 U/μL) 酒精 70%酒精 TE (10 mM Tris-Cl, pH 8.0; 1 mM EDTA) 方法步骤: ◆ 以下反应条件与步骤主要参照random priming kit 制造厂商所的产品说明书。 1) 取100 ng 模版DNA,加入适量去离子水,把体积补足为15 μL. 2) 于沸水中加热10 min. ◆ 请记得以夹子固定微量离心管的管盖部份,以免离心管在加热过程中盖子爆开、进水! 3) 加热后,迅速把微量离心管移至冰浴中,静置数分钟。 4) 离心数秒后,依序加入下列三种试剂: 2 μL hexanucleotide mix 2 μL dNTP mixture 1 μL Klenow enzyme 5) 以指头轻弹离心管,以便混合均匀。 6) 短暂离心后,置于37℃恒温水槽中作用2 h. ◆ 反应时间至少须要1 h,长可反应过夜。 7) 作用完毕的后,加入2 μL 的0.2 M EDTA,以便终止DNA 聚合反应。 8) 加入2.5 μL 4 M LiCl及75 μL纯酒精,混合均匀,置 -20℃过夜。 隔天: 1) 于13,000 rpm,4℃离心15 min. 2) 倒出上清液,加入50 μL 的70%酒精,再离心5 min. 3) 倒出上清液并风干DNA. 4) 后以50 μL TE 溶解DNA. 华东生物器材网(www.jp1718.com)是上海金鹏旗下网站。本网是专业的生化器材网站,集生产、制造、销售于一体。优势产品有紫外分析仪、核酸蛋白检测仪、凝胶成像分析系统、低压液相色谱分离仪、自动部分收集器、梯度混合器、旋转蒸发器等生物仪器,是销售生化器材品种**,规模庞大的专业企业。 上海金鹏分析仪器有限公司 www.jp1718.com 电话: 61425398 36162366 手机: QQ:964122960,765695826, 842727501, 2460311703, 2431022418,170324176 传真: 地址:上海市真陈路1398弄15号 邮编:200444