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iFOLD蛋白重折叠三兄弟
俗话说,巧妇难为无米之炊,蛋白质的结构与功能研究当然也离不开大量的高纯蛋白。要想获得大量蛋白,娇贵的哺乳动物细胞可很难做到,主要依靠大肠杆菌表达系统,操作简单,价格便宜量又足。然而,大肠杆菌中生产的外源蛋白量是不少,却常常形成包涵体,让人欢喜让人忧。虽说包涵体也有不少优点,诸如易纯化、耐蛋白水解等,但要想摸索出合适的条件,让包涵体重折叠成天然的构象,自然少不了一番周折。如果能同时筛选多个重折叠条件,那将会节省不少时间,且增加成功的几率,起到事半功倍的效果。
默克旗下Novagen就开创性地推出了这样的系统——iFOLD蛋白重折叠三兄弟。这三兄弟各带有一块96孔板,上面分别有92(老大)、94(老二)和91(老三)种独特的缓冲液。这些缓冲液成分是根据REFOLD数据库(
http://refold.med.monash.edu.au
)和众多成功重折叠的文献而确定的,内含特定pH值、盐、环式糊精、氧化还原试剂以及重折叠添加剂的不同组合。
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iFOLD三兄弟中的老幺是在去年底上市的,它的独特之处是采用全新的化学试剂—FoldACE—作为主要的复性添加剂。这个FoldACE试剂是什么来头?有什么好处呢?它是从一个能增加蛋白回收率的化学试剂库中筛选出来的。FoldACE试剂共有五种,每一种都是水溶性的有机盐,分子量小于500Da。它们不是去污剂,也不会形成胶束。在蛋白复性之后,FoldACE试剂可以通过金属螯合亲和层析或分子筛的方法有效去除,透析或超滤也可以。实验表明,它们能显著增强某些蛋白的折叠效率。
除了FoldACE试剂,iFOLD3系统复性缓冲液的pH缓冲液成分也是五选一,分别是Bis-Tris、MOPS、HEPES、EPPS和TAPS。孔中还包含了还原剂(TCEP)或谷胱甘肽氧化还原缓冲液。iFOLD3能根据不同的缓冲液、pH值、氧化还原剂和FoldACE试剂的组合,筛选一个蛋白的91种复性条件(91个实验孔和5个对照孔)。
点击索取iFOLD重折叠系统的更详细资料!
筛选流程如下:
起始物质:包含目标蛋白的细胞 → 收集细胞 → 超声裂解细胞,并加入Lysonase生物处理试剂 → 离心收集包涵体 →用Triton X-100洗涤包涵体 → 用盐酸胍变性包涵体 → 用iFOLD 3平板快速复性目标蛋白 → 用D-Tube96透析器透析缓冲液 → 分析复性蛋白
iFOLD 蛋白重折叠三兄弟的比较:
iFOLD
系统
1
iFOLD
系统
2
iFOLD
系统
3
包涵体洗涤剂
1.0%Triton-X-100
0.125 M
NDSB-201(
或
Triton X-100)
1.0%Triton-X-100
(或
NDSB-201
)
包涵体变性剂
4.4%N-lauroylsarcosine
7.0 M
GuHCl
(或
8.0 M
尿素)
7.0 M
GuHCl
包涵体还原剂
5 mM
TCEP
10 mM
TCEP
1.0 mM
TCEP 1
5.0 mM
TCEP 2
6.0 mM
+ 4.0 mM GSH + GSSG1
8.0 mM
+ 2.0 mM GSH + GSSG2
9.5 mM
+ 0.5 mM GSH + GSSG3
变性的目标蛋白浓度
1mg/ml
5mg/ml
10mg/ml
每孔中的总蛋白
50 ug
50 ug
100 ug
缓冲液体积(
50 mM
)
Tris-HCl, pH 7.0,7.5, 8.0
或
8.5
MOPS, pH7.0
HEPES, pH7.5
EPPS, pH8.0
TAPS, pH8.5
CHES, pH9.0
Bis-Tris, pH6.0
MOPS, pH7.0
HEPES, pH7.5
EPPS, pH8.0
TAPS, pH8.5
重折叠添加剂
100mM
NaCl
250mM
NaCl
1.0mM
TCEP
3.8mM
GSH + 1.2 mM GSSG
1.0mM
EDTA
1.0mM
CaCl
2
+ 1.0 mM MgCl
2
0.5M
GuHCl
20%glycerol
0.1%PEG6000
0.5M
L-arginine
12.5mM
环式糊精
24mM
NaCl + 1.0 mM KCl
240mM
NaCl + 10 mM KCl
1.0mM
TCEP
9.0mM
GSH + 1.0 mM GSSG
6.0mM
GSH + 4.0 mM GSSG
1.0mM
EDTA
0.25mM
each of CaCl
2
,MgCl
2
,MnCl
2
& ZnCl
2
0.5 or 1.0 MNDSB-201
0.5 or 1.0 MNDSB-256
1.5M
sorbitol
0.58M
trehalose
0.06%PEG3350
0.5M
L-arginine
10mM
环式糊精
FoldAce
试剂
1
FoldAce
试剂
2
FoldAce
试剂
3
FoldAce
试剂
4
FoldAce
试剂
5
iFOLD系统的特征包括:
覆盖近300个重折叠条件
包括纯化包涵体的所有试剂
含有96孔板重折叠缓冲液矩阵
测试pH范围在7.0-9.0之间
重折叠添加剂包括盐、环式糊精、氧化还原剂、;离液盐、NDSB和独特的FoldACE试剂
重折叠条件基于众多文献和REFOLD数据库
有了iFOLD重折叠三兄弟的帮助,相信枯燥冗长的实验摸索可以很快完成,并让你迅速走上蛋白结构与功能研究的光明大道。
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