作为PCR技术的原创***,ABI公司一直以PCR为傲。无论是试剂还是仪器,ABI都一直**着PCR的发展方向。说到ABI的Taq酶,每个人都会想到大名鼎鼎的**酶-AmpliTaq Gold。此酶俨然ABI定量PCR试剂中的金字招牌,尽管价格不菲,却还是定量PCR用户的优选。另外一种AmpliTaq DNA聚合酶也是用户基础庞大,你也许猜不到,它还是世界上引用次数*多的DNA聚合酶。照理说,有了这两个明星产品,ABI完全可以躺在功劳簿上睡大觉,但如果真是那样,就绝非我们所认识的ABI了。
这家以**为灵魂的公司继续在PCR领域**,推出了全新的AmpliTaq?360家族产品,包括AmpliTaq? 360和AmpliTaq? Gold 360DNA聚合酶,分别作为AmpliTaq和AmpliTaqGold的升级。360意味着为您打造360度的全方位扩增空间,从日常到更具挑战性的模板。新产品与老产品相比,性能有了**提升。首先是纯度更高,**DNA减少,其次与360GC增强剂和全新的缓冲液共同使用,PCR成功扩增的几率更高。
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这两个系列的DNA聚合酶都可以单独购买,或与改良版的缓冲液试剂盒共同购进,缓冲液试剂盒包括全新的AmpliTaq(或AmpliTaqGold)360缓冲液、MgCl2及360 GC增强剂。AmpliTaq Gold 360还有方便使用的2×MasterMix形式。
360 GC增强剂
360GC增强剂可是个新面孔,以前不曾见过,那咱们就从它说起吧。顾名思义,它肯定和GC含量有关。360GC增强剂适用于难扩增的模板,尤其是GC含量高或GC重复多的模板。增强剂还增加了反应的特异性,避免局部GC含量高的模板产生非特异的产物。你可以调整360GC增强剂的用量,来优化PCR反应。如果反应中出现非特异产物,可以添加少量的增强剂。如果模板的GC含量高,可能需要更多的增强剂。
生物通提示:在初次扩增时,不要添加360GC增强剂。如果扩增失败或出现非特异的产物,可以添加适量的360GC增强剂。如果是减少非特异条带,增强剂的比例为2-5%(体积比)。如果GC含量在65%以上,建议从10%的比例开始摸索。GC含量越高,比例越大。不过,需要提醒的是,对于某些非富含GC的模板序列,360GC增强剂的使用可能会降低产量。
AmpliTaq (Gold) 360DNA聚合酶
AmpliTaq 360 DNA聚合酶,在与全新的AmpliTaq 360缓冲液及可选的360GC增强剂共同使用时,能扩增超大范围的DNA序列模板。常规模板自不必说,关键就要看富有挑战性的困难模板,大家好,才是真的好!
对于富含AT、富含GC、形成引物二聚体的序列等困难重重的序列,过去需要多次优化,而现在只用AmpliTaq 360DNA聚合酶在标准条件下就能重复扩增。通过40多个目标序列的竞争性标杆分析,表明AmpliTaq 360DNA聚合酶具有*佳性能,能确保日常及挑战性目标的成功扩增几率*大。
与先前的版本相比,AmpliTaq360系列的DNA聚合酶经过了一步额外的纯化,去除了污染的**DNA。于是,至纯的酶,再加上验证和优化过的缓冲液系统,赋予了它们****的灵敏度。360系列的DNA聚合酶能有效扩增低拷贝数的目标,因此特别适于低拷贝的病原体检测,和部分降解的DNA样品中目标的扩增。
AmpliTaq Gold 360 DNA聚合酶与AmpliTaq360DNA聚合酶大体相似,不过前者多了个热启动的特性。室温下无活性,需要一个高温孵育步骤来激活聚合酶,确保酶只在DNA完全变性后才有活性。这样保证了反应的特异性,在室温下配置PCR反应时,也无需顾虑引物的错误延伸。随着循环数的增加,反应中DNA聚合酶的量也缓慢增加,特异产物的量也在增多,而没有非特异产物的积累。这种杰出的特异性非常适合多重分析和等位基因分辨。
测序也是**酶的一大应用。将原先的AmpliTaq GoldDNA聚合酶和AmpliTaq Gold 360DNA聚合酶所获得的测序结果相比,结果相当或后者更佳。对于某些**酶无法扩增的模板,AmpliTaq Gold 360DNA聚合酶与360 GC增强剂的组合也获得了漂亮的测序结果。
不过,美中不足的是,这两种DNA聚合酶只能对付5kb以下的序列。对于人类基因组DNA,它们能有效地扩增*多3 kb,质粒DNA则达到5kb,再长的片段就无能为力了。至于超长的片段,您可以选择ABI公司的GeneAmp XL PCR Kit,它就是专为5-40kb的片段而设计的。
NIH的甲基化研究
美国国立卫生研究院的Lawrence Brody博士和PatriciaPorter-Gill女士*近正在研究叶酸对甲基化状态的影响。他们需要扩增1000bp或更长的富含GC的序列。然而,他们目前使用的DNA聚合酶无法通读这些片段。于是,Brody和Porter-Gill选择了ABI的新产品AmpliTaqGold 360 Master Mix。
他们的PCR扩增是两方面的,既要在亚硫酸氢盐处理之前扩增野生型的富含GC序列,又要在处理之后利用亚硫酸氢盐转化的引物扩增相同的区域。由于亚硫酸氢盐处理过的DNA相对不稳定,大部分聚合酶都很难在这些长的CpG岛上移动,这让基因组扩增陷入了困境。然而,AmpliTaqGold 360 Master Mix却轻松扩增了800-900 bp的CpG岛,1100bp的靶点也能成功扩增。扩增子测序后,Brody和Porter-Gill在存在甲基化的CpG岛位置发现了C碱基,并能够定量甲基化的程度。
Brody博士和Patricia Porter-Gill认为,“1000bpCpG岛的成功扩增是相当了不起的。这种新能力让我们开始着手更大的问题。*终,我们想建立每个感兴趣基因的甲基化图谱,确切地显示甲基化存在于启动子的哪个区域。”
现在,你终于相信AmpliTaq360系列DNA聚合酶的威力了吧。如果您正在从事与Brody博士类似的甲基化研究,或者也有着难以对付的DNA模板,那就赶快来尝试一下吧。点击索取更多资料!