杆状病毒的滴定过去常采用空斑分析,不过此方法耗时约1个星期,实在是有些漫长。为此,Clontech公司推出了BacPAK? qPCR Titration Kit,作为空斑分析的替代,来快速准确地滴定AcMNPV类型的杆状病毒。
此试剂盒采用快速的DNA纯化步骤,并利用qPCR和SYBRGreen检测来确定病毒DNA基因组的含量。由于qPCR滴定非常快速,目的细胞的感染和病毒粒子的收获就可在同**进行,也就避免了反复冻融对病毒感染效率的影响。这种方法能够让你以已知的感染复数(MOI)感染细胞,从而获得更准确、一致的结果。
以往,耗时的滴定方法、延长的病毒储存时间和反复冻融都影响了病毒储存液的感染效力,研究人员在若干天后获得的只是感染力和MOI的近似值。qPCR滴定方法比空斑分析要快得多(详见下表),因此在收获病毒粒子的当天就能感染目的细胞。这样快速的周转*大限度地保持了病毒活力。
表1. BacPAK qPCRTitration Kit与其他滴定方法的比较
滴定方法
空斑分析
BacPAK Rapid Titer Assay
BacPAK qPCR Titration Kit
简介
计算感染后单层细胞的空斑
对感染后细胞单层的Gp64进行**染色
利用SYBR qPCR来测定病毒DNA,用标准DNA作为对照
耗时
一星期
48小时
2-4小时
优势
传统、可见
简单、可见
快速、准确
BacPAK qPCR TitrationKit的操作过程如下:收集病毒上清,利用病毒DNA纯化试剂盒从少量上清中提取基因组DNA。将病毒DNA样品连续稀释,进行定量PCR,来确定每个浓度的Ct值,再根据对照模板的标准曲线计算出样品中的DNA基因组拷贝数。
一旦基因组拷贝数确定,它就能与病毒感染力相关联,从而确定拷贝数/PFU的关系。这个比例的确定能让你标准化每次实验所使用的样品量,得到更为一致的分析间结果。
介于其简单、重复性好、处理时间短,BacPAK qPCRTitration Kit成为确定杆状病毒滴度的理想选择。另外,Clontech还提供了BacPAK Rapid TiterKit,利用AcMNPV衣壳蛋白Gp64的抗体对病毒感染过的细胞进行**染色。此过程虽不如定量PCR那么快,但也比空斑分析快很多,且结果较为直观。