Label free: 非标定量蛋白质组学技术;
比如你有10个组织样品,分别提取蛋白质并酶解成肽段。然后每一个肽段样品进行LC-MS分析,这样就得到10个MS数据;
对于1条肽段,其在10个样品中的丰度(量)与其在MS1中的峰面积或信号强度成正比;
理论上,对于10个样品中的同一条肽段,其在LC上的保留时间(retention time, RT)是一致的,因此,可以通过对比MS图谱,实现对蛋白质在不同样本中的相对表达水平的定量分析。
Label free技术特色:
1、与SILAC, iTRAQ/TMT技术相比,样品无需标记,能终程度地保留样品的“真实性”;
2、样品处理步骤简单,蛋白质只需酶解即可进行LC-MS分析;
3、能很大程度的节省样本制备费用。
Label free分析软件
Maxquant,Progenesis 等