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PCR引物设计的一般原则是什么? 

日期:2024-11-22 06:25
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摘要: PCR引物设计的一般原则是什么? 1、引物长度:15-30bp,一般为20bp左右。 2、引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带。上下游引物的GC含量不能相差太大。A/T/C/G*好随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。 3、引物结构:避免引物3’端出现互补序列及二级结构,3’端的碱基特别是*末及倒数第2个碱基,应严格要求配对。 4、引物中酶切位点一般加在5’端,合适的酶切位点便于后续实验中的酶切分析或分子克隆。 5、引物浓度:每条引物浓度0....

PCR引物设计的一般原则是什么?

1、引物长度:15-30bp,一般为20bp左右。

2、引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带。上下游引物的GC含量不能相差太大。A/T/C/G*好随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。

3、引物结构:避免引物3’端出现互补序列及二级结构,3’端的碱基特别是*末及倒数第2个碱基,应严格要求配对。

4、引物中酶切位点一般加在5’端,合适的酶切位点便于后续实验中的酶切分析或分子克隆。

5、引物浓度:每条引物浓度0.1-1umol或10-100pmol,以*低引物量产生所需要的结果为好,引物浓度偏高会引起错配和非特异性扩增,且可增加引物间二聚体的形成机会。