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影响PCR特异性的因素分析
日期:2024-11-03 23:35
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摘要:
有许多因素可以影响PCR的特异性,在此我们作一归纳,供大家参考:
1、退火步骤的严格性:提高退火温度可以减少不匹配的杂交,从而提高特异性。
2、减短退火时间及延伸时间可以减少错误引发及错误延伸。
3、引物二聚体是常见的副产品,降低引物及酶的浓度也可以减少错误引发,尤其是引物的二聚化。
4、改变MgCl2(有时KCl)浓度可以改进特异性,这可能是提高反应严格性或者对Taq酶的直接作用。
5、模板中如果存在次级结构,例如待扩增的片段易自行形成发夹结构时,可在PCR混合物中的4×dNTPs中加...
有许多因素可以影响PCR的特异性,在此我们作一归纳,供大家参考:
1、退火步骤的严格性:提高退火温度可以减少不匹配的杂交,从而提高特异性。
2、减短退火时间及延伸时间可以减少错误引发及错误延伸。
3、引物二聚体是常见的副产品,降低引物及酶的浓度也可以减少错误引发,尤其是引物的二聚化。
4、改变MgCl2(有时KCl)浓度可以改进特异性,这可能是提高反应严格性或者对Taq酶的直接作用。
5、模板中如果存在次级结构,例如待扩增的片段易自行形成发夹结构时,可在PCR混合物中的4×dNTPs中加入7-脱氮-2’-脱氧鸟苷-5’-三磷酸(7-deaza-2’-deoxyguanosine-5’-trihosphate)(de7GTP)。用de7GTP与dGTP比例为3:1的混合物(150μmol/l de7GTP +50μmol/L dGTP)代替200μmol/l dGTP,则可阻非特异性产物的**。